Hierarchy For Package fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop
Package Hierarchies:Class Hierarchy
- java.lang.Object
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.AbstractModule (implements fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.core.Module)
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractFilterAndMapReadsModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.FilterAndMapReadsHadoopModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractReadsFilterModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.ReadsFilterHadoopModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractReadsMapperModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.ReadsMapperHadoopModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractSAM2BAMModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAM2BAMHadoopModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractSAMFilterModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAMFilterHadoopModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.AbstractFilterAndMapReadsModule
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.HadoopBamUtils
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.HadoopMappingUtils
- org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper<KEYIN,VALUEIN,KEYOUT,VALUEOUT>
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.PreTreatmentMapper
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.ReadsFilterMapper
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.ReadsMapperMapper
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAMFilterMapper
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.PairedEndFastqToTfq
- org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer<KEYIN,VALUEIN,KEYOUT,VALUEOUT>
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.PairedEndFastqToTfq.FastqPairedEndReducer
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.PreTreatmentReducer
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAMFilterReducer
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAMHeaderHadoopUtils
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.mapping.hadoop.SAMHeaderHadoopUtils.SAMHeaderWriter
- fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.modules.AbstractModule (implements fr.ens.biologie.genomique.eoulsan.core.Module)